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Isla Contoy
Al sur de la isla se encuentra el arrecife Ixlaché, que marca el inicio de la segunda barrera arrecifal más larga del mundo en el Gran Arrecife Mesoamericano.El 99% se encuentra en estado natural y el Gobierno federal ha destinado menos de 2 hectareas para uso turístico y del personal que presta sus servicios en la isla.
El 29 de octubre de 1986 se decretó la playa de la isla como zona de reserva para la protección de tortugas marinas.
Esta isla es un sitio de anidación de gran relevancia de aves marinas y palustres, y contiene la colonia más importante de pelícano gris (Pelecanus occidentalis) en la costa este de México.
La isla provee también sitios de anidación para el halcón peregrino (Falco peregrinus)(A) que ha estado regresando en los últimos años. Durante el verano otras especies visitan la isla con el propósito de buscar refugio o reproducirse, tales como el bobo vientre blanco (Sula leucogaster). Además se puede encontrar al cormorán, la fragata magnífica (Fregata magnificens) y la garza gigante (Ardea herodias)(R) entre otras. Respecto de los reptiles, se han registrado 14 especies.
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El tiburon ballena (Rhincodon typus) es el pez existente mas grande del mundo, llega a medir hasta 12 metros de longitud.
Es una de las tres especies de tiburones que se alimentan mediante un mecanismo de filtración del agua, Se alimenta principalmente de fitoplancton,Los numerosos dientes de que dispone no juegan ningún papel determinante en la alimentación, de hecho, son de reducido tamaño. En lugar de dientes, el tiburón ballena succiona gran cantidad de agua, y al cerrar la boca la filtra a través de sus peines branquiales.
La temporada de tiburon ballena es a partir del mes de Mayo a Septiembre y se les puede localizar en los alrededores de isla contoy y isla Holbox.
El tiburon ballena no representa peligro alguno para el ser humano.
Un dato interesante es que son ovoviviparos que es el proceso de gestación en un huevo que permanece en el cuerpo de la madre hasta después de abrirse la cáscara.